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如何快速測(cè)量細(xì)胞劃痕寬度?
發(fā)布時(shí)間: 2021-12-22 點(diǎn)擊次數(shù): 1473次細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)可謂是性價(jià)比高的一個(gè)小實(shí)驗(yàn)了。可以在不額外購(gòu)買實(shí)驗(yàn)設(shè)備的情況下,一定程度地評(píng)價(jià)腫瘤細(xì)胞或者成纖維細(xì)胞的遷移能力。
在課題組經(jīng)費(fèi)的限制下,這個(gè)實(shí)驗(yàn)成為很多老板的*。
細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)本身的操作很簡(jiǎn)單,網(wǎng)上有很多教程,此處不贅述。當(dāng)你辛辛苦苦拿到了下面這張照片時(shí),說明你已經(jīng)成功了一大半。
接下來的工作就是測(cè)量,本文將以此為例,寫出測(cè)量的圖文教程。
1. 下載并安裝Image Pro Plus。
2. 點(diǎn)擊File→Open,打開你需要測(cè)量的圖片。
3. 增強(qiáng)細(xì)胞劃痕邊界的信號(hào),以提高IPP識(shí)別準(zhǔn)確度。點(diǎn)擊Process,點(diǎn)擊過濾器Filters。
4. 在Filters彈窗中,依次選擇以下參數(shù),需要做3步。 (4.1)在Edge選項(xiàng)下,選擇Sobel。然后鼠標(biāo)拖右側(cè)的小窗口,將細(xì)胞劃痕的邊緣拖到這個(gè)窗口處,意在增強(qiáng)這個(gè)邊界。
點(diǎn)擊Apply之后,可以看到目標(biāo)圖片已經(jīng)發(fā)生改變,邊界更加清晰了。
(4.2)在Morphological選項(xiàng)下,選擇Close。然后鼠標(biāo)拖右側(cè)的小窗口,使得細(xì)胞占滿這個(gè)窗口。此步意在通過算法將細(xì)胞區(qū)域中的空隙都填充上顏色,以提高IPP的自動(dòng)識(shí)別準(zhǔn)確度。
點(diǎn)擊Apply之后,可以看到目標(biāo)圖片再次發(fā)生改變。
(4.3)在Enhancement選項(xiàng)下,選擇Lopass,選擇5X5,然后鼠標(biāo)拖右側(cè)的小窗口,使得劃痕邊界處在這個(gè)窗口。此步驟意在調(diào)整劃痕邊界的平滑度。
點(diǎn)擊Apply之后,可以看到目標(biāo)圖片又一次發(fā)生改變。
5. 增強(qiáng)圖片的對(duì)比度。
(5.1)點(diǎn)擊Enhance,選擇Contrast Enhancement,調(diào)出下面的設(shè)置界面彈窗。
(5.2)拉動(dòng)圖中的曲線,以獲取合適的對(duì)比度。(當(dāng)然你也可以點(diǎn)擊彈窗中Save選項(xiàng),保存這個(gè)對(duì)比度文件。后面測(cè)量其它圖片時(shí),到了這一步可以點(diǎn)擊Load調(diào)出設(shè)置文件。這種操作更有利于減小測(cè)量誤差。)
6. 點(diǎn)擊矩形工具,將圖中的細(xì)胞寬度框選。如下圖。
7. 點(diǎn)擊Measure中的count/size選項(xiàng),彈框中點(diǎn)擊measrue,再點(diǎn)擊select measurement。測(cè)量參數(shù)選擇Area和Box Height。調(diào)整Area最小測(cè)量值為1000,以便于過濾小面積區(qū)域。(注意:如果你的細(xì)胞劃痕圖像是橫著的,那就要選擇Box width)。點(diǎn)擊OK。
8. 最關(guān)鍵的一步。在manual模式下,點(diǎn)擊select colors,進(jìn)入選色界面。在HSI模式下通過調(diào)整0-255數(shù)值或拉動(dòng)圖中曲線,保證我們畫的矩形選框中盡可能的被填滿紅色。
同樣的,你可以點(diǎn)擊彈窗中的File按鈕來保存你的設(shè)置文件,測(cè)量其它圖片時(shí)之間調(diào)用,以減小測(cè)量誤差。完成后點(diǎn)擊close。
9. 在count/size界面選擇Option,然后按照下圖進(jìn)行設(shè)置。最關(guān)鍵的是選擇filled。完成后點(diǎn)擊OK。
10. 點(diǎn)擊count,可以看到劃痕區(qū)域被選擇為多個(gè)測(cè)量區(qū)域,且存在一個(gè)最大測(cè)量區(qū)域被紅色全部充滿。這樣的測(cè)量才是符合的。
11. 點(diǎn)擊View,查看數(shù)據(jù)。其中最大面積及其對(duì)應(yīng)的高度值就是我們需要的數(shù)據(jù)。
12. 細(xì)胞劃痕寬度
細(xì)胞劃痕平均寬度=細(xì)胞劃痕最大測(cè)量面積 / 對(duì)應(yīng)的長(zhǎng)度 (eg,本例中細(xì)胞劃痕最大的測(cè)量面積是1954623,對(duì)應(yīng)長(zhǎng)度為2531,那么細(xì)胞劃痕平均寬度就是772.3)
13. 測(cè)量單位的問題
首先,你的所有圖片應(yīng)該是在同一倍數(shù)的鏡下拍攝,一般10X。此時(shí)你采用IPP測(cè)量的寬度數(shù)值單位是“像素",如果是多組間的比較,是否有單位對(duì)于組間比較無(wú)影響。
至于這個(gè)像素所代表的實(shí)際尺寸,則必須在該顯微鏡10X倍數(shù)下重新拍攝一個(gè)標(biāo)尺,然后使用這個(gè)標(biāo)尺進(jìn)行像素與尺寸的換算,最終得到細(xì)胞劃寬度的實(shí)際尺寸。
以上就是本期的內(nèi)容,更多資訊,歡迎關(guān)注安培生物科技有限公司了解更多技術(shù)與產(chǎn)品資訊。
安培生物科技有限公司介紹:
安培生物堅(jiān)持為生命科學(xué)研究、活體動(dòng)物轉(zhuǎn)染、大規(guī)模生物生產(chǎn)、基因和細(xì)胞治療領(lǐng)域客戶,提供*細(xì)胞體內(nèi)可代謝的核酸轉(zhuǎn)染試劑;inviCELL™Platelet lysate無(wú)動(dòng)物血清產(chǎn)品旨在支持廣泛的細(xì)胞擴(kuò)增和生產(chǎn),包括培養(yǎng)間充質(zhì)干細(xì)胞和多種免疫細(xì)胞系等,為制藥公司或者生物技術(shù)公司提供無(wú)血清細(xì)胞培養(yǎng)規(guī)模生產(chǎn)服務(wù);提供以植物生物為平臺(tái)基因序列全人源化、*的細(xì)胞培養(yǎng)可分解3D基質(zhì)膠產(chǎn)品;提供內(nèi)毒素≦ 1.0 EU/mL、對(duì)細(xì)胞無(wú)毒性影響、高純度的一型膠原蛋白產(chǎn)品。安培生物專注為生物醫(yī)藥領(lǐng)域提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù),努力發(fā)展為基因治療、細(xì)胞治療的生物科技企業(yè)
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